Инженер из Сиднея Пол Конингем не является биологом или ветеринаром. Он имеет почти два десятилетия опыта в области науки о данных и искусственного интеллекта. В 2024 году у его собаки Рози диагностировали рак тучных клеток — самый распространённый вид рака кожи у собак, который практически не поддаётся стандартному лечению. После неудачных попыток традиционной терапии Конингем начал искать альтернативное лечение с помощью ChatGPT.
ChatGPT помог выстроить план и выйти на учёных UNSW
Модель OpenAI стала для Конингема исследовательским ассистентом и помогла выстроить план работы в новой для него области. ChatGPT предложил рассмотреть иммунотерапию и указал на Центр Рамачотти геномики при Университете Нового Южного Уэльса. После этого Конингем связался с ассоциированным профессором Мартином Смитом и начал сотрудничество с научным подразделением.
Секвенирование опухоли и анализ мутаций с помощью ИИ
Конингем заплатил 3 000 долларов за секвенирование ДНК опухоли Рози. Такой запрос показался Мартину Смиту необычным, поскольку центр обычно не поддерживает секвенирование по инициативе частных лиц из-за сложности интерпретации данных. Конингем пояснил, что он аналитик данных и планирует анализировать результаты с помощью ChatGPT.
После получения данных он использовал ChatGPT и другие ИИ-инструменты для выявления значимых мутаций. Затем Конингем применил AlphaFold — программу Google DeepMind для предсказания трёхмерной структуры белков. Это позволило смоделировать мутации, которые могли стимулировать рост опухоли, и определить потенциальные препараты, после чего он представил результаты исследователям UNSW.
Вакцина ARNm, инъекция и подтверждённый результат
Исследовательская группа выявила перспективный препарат иммунотерапии, однако производитель отказался предоставить его для такого применения. После этого Мартин Смит предложил рассмотреть вакцину ARNm — вакцину на основе матричной РНК. Конингем согласился изучить этот вариант и в течение двух месяцев подготовил документ объёмом 100 страниц, после чего получил этическое одобрение для экспериментов с живыми существами.
Подразделение UNSW под руководством профессора Палла Тордарсона изготовило вакцину по формуле объёмом в полстраницы, разработанной Конингемом. Для введения препарата он связался с Рэйчел Аллавеной, профессором иммунотерапии собак в Университете Квинсленда. В декабре Конингем проехал десять часов вместе с Рози, после чего Аллавена сделала первую инъекцию.
Исследователи UNSW и Университета Квинсленда подтвердили, что одна из опухолей Рози уменьшилась вдвое. При этом другой, более крупный опухолевый очаг на вакцину не отреагировал. Испытания не включали контрольную группу и не содержат долгосрочных данных. Сейчас UNSW проводит секвенирование генома опухоли, которая не ответила на лечение, с целью разработки второй ARNm-вакцины.
Оригинал: источник
